動物糞便直接用作肥料的危害：
首先，動物糞便含有大腸菌.直接使用寄生蟲線蟲、蟲卵等細菌和害蟲會導致病蟲害的傳播.作物的發病會吸引蒼蠅產卵，污染環境，影響食用農產品的人的健康。
其次，未經處理的動物糞便含有大量未消化的有機物，不僅不能直接用于作物，還會造成“二次發酵”現象。當作物小，抵抗力弱時，發酵產生的熱量會影響生長，導致燒根.幼苗燃燒，甚至導致植物死亡。
第三，未發酵腐爛的動物糞便多為大分子有機物，不能直接被作物吸收利用，肥效極慢。
優質有機肥堆肥發酵過程一般需要45-60天。這是因為植物致病菌會在堆肥的早期加熱和高溫階段被殺死.蟲卵.雜草籽等有害微生物，但微生物的主要作用是代謝.繁殖只產生少量代謝物，這些代謝物不穩定，不易被植物吸收。那么，將糞便成熟發酵成有機肥需要什么條件呢?
1.水。保持適當的含水量是促進微生物活性和堆肥發酵的首要條件。一般來說，最大持水量的60%-75%適合堆肥材料。
2.通風。保持堆內適當的空氣，有利于氣微生物的繁殖和活動，促進有機物的分解。高溫堆肥時，應注意適度的松緊堆積，以促進通風。
3.保持中性或微堿性環境。適量添加石灰或石灰土，中和酸度，促進微生物繁殖和活性。
4.碳氮比。微生物正常分解有機質的碳氮比為25∶1.豆科綠肥碳氮比為15-25∶1.雜草為25-45∶1.禾本科作物莖60-1000∶1.因此，根據堆肥材料的類型，添加適量的含氮物質，以降低碳氮比，促進微生物活動。
一些基地購買雞糞.豬糞自制有機肥，牲畜家禽糞便不能直接使用，必須發酵腐爛才能安全使用。未腐爛的有機肥含有某些病原體.病毒.線蟲.根螨.雜草種子等，導致植物田間病害頻發.雜草叢生;同時，未腐爛的有機肥在分解過程中產生有害氣體，容易引起燒根.土壤缺水等危害。
5.堆放材料：一些含水量大的糞便需要添加一些輔助材料進行輔助發酵。主要由主要材料制成.輔料.由發酵劑或生石灰組成。主料為牛.羊.豬.兔糞約占80%;輔料是各種作物秸稈.菌渣.枯枝落葉.鋸末等，約占20%;其他:發酵劑(有條件的可以買，不用)
6.在春.夏.秋季，室外溫度保持在20歲℃以上堆放。在位置上，最好選擇日出.地勢稍高.有利排水.開闊地便于運輸。
7.堆放方法:工序依次將主料.輔料等混合.調節水(水控制在60%左右).建堆(寬2米.高1米，長度不限).密封堆(每1-2米插入氣孔或少量玉米秸稈，為微生物提供氧氣通道，用塑料布密封).堆(當堆內溫度達到60℃翻堆，補充水分)。
8.有機肥必須完全腐爛。腐爛標準:堆溫降至40℃下面，保持不變。堆肥濕度低于35%，無原料氣味，略有氨味。腐爛的堆肥是深棕色的，汁液是淺棕色或無色的。堆里產生白色菌絲。大多數有機肥通常都含有細菌因此，將辛硫磷等殺蟲劑添加到堆肥發酵的有機肥中.殺菌劑應在使用前使用。如果未經腐爛的糞便直接施用到土壤中，可能會燒苗;同時，有機肥含有大量的蟲卵.細菌，不腐熟會對作物造成嚴重傷害。
近年來，隨著有機肥使用的推廣和國家環保育種的大力推廣，以及許多自動發酵畜禽糞便設備，如高溫好氧智能發酵罐，可直接將糞便輸送到成品粉狀有機肥，大大提高了發酵成本，降低了時間勞動力成本，移動履帶發酵堆機，也大大節省了時間勞動力成本，材料混合.破碎.篡堆已成為越來越多養殖企業和有機肥企業的選擇。
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