有機肥發酵物料的分解主要發生在顆粒的表面或接近顆粒表面的地方，由于氧氣可以擴散進入包裹顆粒的水膜，所以這些地方有足夠的氧氣保證有氧代謝的需求。
在相同體積或質量的情況下，小顆粒要比大顆粒有更大的表面積。所以如果供氧充足，小顆粒物料一般降解得要快一些。實驗證明將發酵物料加以粉碎后，可以使降解速率提高2倍以上。一般推薦的顆粒粒徑為1.3～7.6mm，這個區間的下限適用于通風或連續翻堆的發酵系統，上限適用于靜態堆垛或其他靜態通風發酵系統。
對濕基質進行結構調整時，調理劑的粒徑大小也會起到非常重要的作用。如果調理劑粒徑過小，會導致難以達到預期的自由通氣孔隙，并可能使混合基質固相體積不易達標。例如，有些發酵系統由于使用粒徑很小的稱為“木粉”的木屑，導致混合基質呈飽和泥狀，由于缺少空隙而易發生厭氧反應。為規范調理劑的使用，美國一些地方規定木屑應不少于總固相的65%，95%可以通過12mm篩，而通過2.23mm的應小于50%；有的規定粗木屑占固相的50%～70%，95%可通過12.5mm篩，通過4.75mm的應小于20%。同時，對粒徑大的顆粒進行限制是為了避免最后的產品顆粒過大而需過篩。如果發酵產品應用于園藝或在草坪、花園上施用時，粒徑一般不要大于10mm。
總之，小顆粒調理劑如木屑等易于生物降解，但從結構角度來看，應避免使用過多的小顆粒。
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