牛糞作為生物質資源處理的目的是將其無害化、減量化與資源化，最大限度地滿足環境的可接受性及經濟上的可行性。隨著經濟的發展和對環保要求的提高，目前，國內外處理畜禽糞便的方法很多，在生產中受到普遍歡迎的是那些投資少、運行成本低并能生產出高附加值產品的技術方法。
1、牛糞生物質資源飼料化利用
牛糞作飼料是將其綜合利用的途徑之一。由于牛糞各種養分含量豐富，經過適當處理后，可提高蛋白質的消化率和代謝能，同時還可殺死病原菌和改善適口性，可作為飼料來利用。目前將牛糞飼料化的處理方法主要有干燥法、分解法和發酵法等。
①發酵法
發酵法是在牛糞中加入某些微生物菌劑或酶制劑以及其他輔料，然后在適宜的溫度下發酵，將所得產品用來喂豬、雞、魚等動物。例如將牛糞進行青貯發酵，只要有足夠的水分和可溶性碳水化合物，牛糞即可同其他禽畜糞便與作物秸稈、飼草或其他粗飼料一起青貯。青貯時，糞便與飼草或其他飼料搭配比例最好是1:1。此法不僅可提高適口性和吸收率，防止蛋白質的過多損失，而且可將部分非蛋白氮轉化成蛋白質，并殺滅幾乎所有的有害微生物。
另外，牛糞混合淀粉渣、米糠和一些酶類物質等經發酵后制作的豬飼料通過飼喂試驗結果表明，一般能夠節省30%～40%的常規飼料，而且豬喜歡食用，豬肉的質量也很好。脫水預處理后的牛糞分別在高低溫兩個溫度下進行兩次發酵，所得飼料中的粗蛋白含量較現有技術獲得的提高23.9%，具有良好的營養價值。而且控制發酵溫度的熱源是采用發酵牛糞后剩余的牛糞經沼氣池發酵獲得的。實驗證明，生物發酵牛糞飼料安全性。指出以15%的生物發酵牛糞飼料添加量效果最好，小鼠體重提高9.25%。試驗也證明了生物發酵牛糞飼料無異味，適口性好，消化率高。
②分解法
分解法，又稱昆蟲法，是利用蠅、蚯蚓和蝸牛等低等動物分解糞便，達到既提供動物蛋白質又能處理糞便的目的。例如用牛糞養蚯蚓，據測算，每平方米培養基可收獲鮮蚯蚓1.5~2萬條，約30~40kg。生產的蚯蚓是優質的動物蛋白，用于釣魚餌料，還可用于醫藥等行業；蚯蚓糞是高效的有機肥，可作為種植蔬菜、花卉、果樹、煙草等的優質有機肥料，且對環境不產生二次污染。牛糞簡單化處理后用來育蛆，然后再用蛆喂雞，這既可提高雞的增重，也可滿足產蛋雞所需的動物飼料蛋白。據統計，100只雞每天可增加產蛋1kg，全年可增加產蛋量100kg，增加收入3 000元，育蛆后的牛糞仍可作肥料施用，其肥效也不減。分解法比較經濟，生態效益顯著。但由于前期糞便滅菌、脫水處理和后期收蠅蛆、飼喂蚯蚓、蝸牛的技術難度較大，加上所需溫度較苛刻，而且難以全年生產，故尚未得到大范圍的推廣。
③干燥法
干燥法分為自然干燥法和機械干燥法。自然干燥法是將新鮮牛糞單獨或摻入一定比例的糠麩拌勻后，攤在水泥地面或塑料布上，隨時翻動，讓其自然風干、曬干，然后粉碎，摻到其他飼料中飼喂。此法成本較低，操作簡便，但受天氣影響大，且易造成環境污染。機械干燥法是采用相關設備進行干燥，可達到去臭、滅菌等目的，也是目前應用較廣泛的干燥法。此外，新型微波處理動物糞便也是較有效的飼料化處理技術。
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