功效全面是復合微生物肥料的第一個特點。
由于復合微生物肥料的配方充分考慮了不同作物的養分需求，克服了單一施肥的弊病，將微生 物肥料的“促”、有機肥料的“穩”、化肥的“速”， 通過科學搭配、優勢互補的原則，將微生物、有機和無 機成分融為一體，既能滿足作物的養分需求，又能改善 土壤的結構，培肥地力，還可提高作物質量、降低病蟲 害，因而受到了市場的廣泛歡迎和好評。
在肥料生產中將速效養分（化肥）與有機質及特定 的活微生物組配在一起不是一件容易的事情，這是因為 無機養分是多種鹽類，它們與普通活微生物混合后，如 達到一定濃度，高滲透壓會將微生物細胞中的水分析出 而造成微生物死亡。簡單的混配不可能達到產品中有效 微生物、無機營養、有機質和諧共存。研發和生產申位 采用選育抗逆性能良好的一種或幾種芽孢菌，配以合理 的工藝路線，使復配之前的微生物為芽孢狀態，大幅度 降低或減少不良條件對微生物的影響，產品施入土壤 后，其中的微生物可以繼續萌發而發揮其作用。另一種 方式則是采用分開造粒并覆膜的方式，即有機物料與微 生物一起造粒，無機養分另外造粒，造粒同時均覆膜， 最大限度地減少了無機養分對微生物的影響，覆膜則起 到了緩釋的作用。特殊技術的采用保證了三種成分的協同作用。此為復合微生物肥料的第二特點。
第三個特點是根據不同的作物需肥特點、不同種植地區的生態特點，采用科學、合理的配比，施用后復合可持續發展的要求，降低了化學肥料的用量和對環境的不良影響。
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